胚胎的遗传学诊断是ＰＧＤ／ＰＧＳ实验室技术的重要步骤之一。传统的单细胞诊断方法主要有荧光原位杂交技术（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅｉｎｓｉｔｕｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ，ＦＩＳＨ）和聚合酶链式反应（ＰＣＲ）。近年来新的遗传学诊断技术，如比较基因组杂交技术（ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅｇｅｎｏｍｉｃｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ，ＣＧＨ）、单核苷酸多态芯片检测技术（ＳＮＰａｒｒａｙ）、以及新一代测序技术（ＮＧＳ）等不断地应用于胚胎的遗传学检测。

一、ＰＣＲ

ＰＧＤ最先使用的方法，通过对基因组特定区域的特异性扩增，结合凝胶电泳、酶切、测序等技术，可以检测胚胎性别、特定基因的点突变、小片段缺失或插入等，也可以通过ｑＰＣＲ检测染色体整倍性。目前ＰＣＲ技术主要应用于单基因病的诊断。２０１４年ＥＳＨＲＥＰＧＤ联盟通过６个ＰＧＤ中心的以ＰＣＲ技术为主的单基因病ＰＧＤ数据，计算出诊断方法的准确度为９３．７％、敏感度为９９．２％、特异度为８０．９％（Ⅳ级）。ＰＣＲ技术面临污染和等位基因脱扣的挑战，容易出现假阳性或假阴性的结果而导致误诊，因此建议和突变点附近的分子标记检测联合使用，以降低ＰＣＲ方法的误诊率。

二、ＦＩＳＨ

利用荧光标记的特异性探针与处于间期的胚胎卵裂球ＤＮＡ杂交，在荧光显微镜下观察荧光信号的数量与分布，反映相应染色体的数目与结构，常用于检测１３、１４、１５、１８、２１、２２、Ｘ及Ｙ染色体的数目异常。１９９４年该技术被首次应用于胚胎性别诊断。用ＤＮＡ插入文库来筛选结合邻近或跨越染色体断裂位点的ＤＮＡ探针，为染色体倒位或者平衡易位的携带者提供一种检测手段，卵裂球活检后检测染色体结构和数量的异常。

传统的ＦＩＳＨ使用的探针数目有限，仅能检测部分染色体，不能完全排除胚胎非整倍体的可能性，最近也有将ＦＩＳＨ应用于２４条染色体整倍性检测的研究报道。此外受卵裂球固定效果和探针的非特异性结合等影响，检测结果难于判断，有时需要根据经验做出主观判断，影响了结果的准确性，目前该方法有被其它技术取代的趋势。

三、ＣＧＨ

利用不同颜色的荧光标记待测样本和正常基因组的ＤＮＡ，然后与正常人类中期染色体（ＣＧＨ）或芯片（ａｒｒａｙＣＧＨ，ａＣＧＨ）进行杂交，通过对比分析两种荧光强度，反映待测样本ＤＮＡ信息。传统的ＣＧＨ需要制备中期染色体，因而目前ａＣＧＨ应用更为广泛。ａＣＧＨ可以在基因组水平检测染色体数目变化以及重复、缺失的情况，但是这种方法不能区分其分辨率以下的片段缺失和重复，不能检测整倍性的改变，如三倍体胚胎、单亲二倍体没有办法判断。

四、ＳＮＰａｒｒａｙ

针对人类基因组平均每５００～１０００ｂｐ即含有的１个单核苷酸多态性位点，对基因组范围ＳＮＰ位点的检测同时可以反映染色体数目异常及片段异常。ＳＮＰ芯片检测的优势在于分辨率高，能够得到每个胚胎的ＤＮＡ指纹信息，在分析染色体数目和片段异常的同时，可以诊断单亲二倍体、还可以确定妊娠胎儿是从哪一个胚胎发育而来。

五、ＮＧＳ

为新一代测序，相对于传统的Ｓａｎｇｅｒ测序，改变了测序的规模化进程，能对几十万到几百万条ＤＮＡ分子同时进行测序，但读长一般较短。将胚胎样本ＤＮＡ打断，构建文库，通过测序后获得的序列信息与人类基因组数据库序列进行比对，可以分析染色体数量变化与片段异常。２００８年后全基因组测序费用呈指数下降，为ＮＧＳ的临床应用提供了条件。